Digitoday

Valikko

Datainfra Euroopan biologiselle tutkimustiedolle

Uudessa EU:n 4,5 miljoonan euron projektissa luodaan eurooppalaisen biologisen tutkimustiedon datalle pysyvä infrastruktuuri.
Euroopan komissio on myöntänyt ELIXIR (European Life Science Infrastructure for Biological Information) -projektille 4,5 miljoonaa euroa valmistelurahaa.

Yleiseurooppalaisen Elixir-projektin valmisteluvaiheen tarkoituksena on löytää paras tapa Euroopan erillisten biologisten dataresurssien yhdistämiseen yhdeksi pysyväksi biotieteiden infrastruktuuriksi.

Korkealla infrastruktuurien ranking-listalla

Tutkimusinfrastruktuureja käsittelevä eurooppalainen strategiafoorumi ESFRI on julkaissut listan merkittävimmistä tutkimuslaitteistoista ja muista infrastruktuureista, joita Eurooppaan tulisi tulevaisuudessa rakentaa. ELIXIR-projekti on yksi näistä.

Tapa, jolla biologista, kuten nukleiinihappoihin, proteiinisekvensseihin ja suurimolekyylisiin rakenteisiin liittyvää tietoa säilytetään, on muuttunut 1980-luvun jälkeen merkittävästi.

Muistivihoista ja akateemisista julkaisuista on päädytty avoimen lähdekoodin tietokantoihin, joissa tietoa on jaettu maailmanlaajuisesti päivittäin.

Nämä tietokannat, ja niissä oleva tieto, ovat korvaamattomia resursseja modernissa biologiassa. Tähän asti ne ovat kuitenkin olleet usein riippuvaisia epävarmasta rahoituksesta, jolloin arvokas data on ollut uhattuna rahoituksen päättyessä.

ELIXIR-projektin tavoite on suojella sekä tietokannoissa jo olemassa olevaa kallisarvoista tietoa että tulevaisuudessa syntyvää dataa. Projekti suunnittelee Eurooppaan optimoidun biotieteiden verkoston, jonka käyttöä tukee vakaa rahoitus.

Tällaisen verkoston perustaminen on strategisesti tärkeä askel, jotta Eurooppa voisi säilyttää johtoasemansa tieteellisessä tutkimuksessa.

Suomesta CSC mukana hankkeessa

ELIXIR-projektia ohjaa eurooppalainen bioinformatiikan tutkimuskeskus EBI (European Bioinformatics Institute). EBI on osa EMBL:ää (European Molecular Biology Laboratory), joka on Euroopan johtava molekyylibiologian tutkimuslaitos. Projektissa on mukana 32 partneria 13 eri maasta.

Tieteen tietotekniikan keskus CSC edustaa Suomea ELIXIRissä. Valmisteluvaiheessa tärkeä tavoite on löytää suomalaisille sopiva rooli muiden eurooppalaisten partnereiden joukossa yhteisessä tutkimuksen infrastruktuurissa.

- On olennaista tunnistaa Suomen tutkimukselle ja elinkeinoelämälle olennaisimmat biologiset dataresurssit ELIXIRissä sekä muodostaa kontakteja ELIXIRin toimintaa täydentäville alueille, kuten lääketieteelliseen tutkimukseen, Tommi Nyrönen CSC:stä sanoo tiedotteen mukaan.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!
    1. 1

      Siepattu ruotsalainen YK-työntekijä löydettiin kuolleena

    2. 2

      Teemu Selänne harmissaan parhaan tutkaparinsa puolesta: ”Surullista, että hän on erittäin katkera jääkiekolle”

    3. 3

      Tunnistaisitko? David Beckham julkaisi rujon kuvan naamastaan – fanit kauhistuivat näystä: ”Mitä sinulle on tapahtunut?”

    4. 4

      Alastomuutta saunassa vaativille suomalaisille löytyi yllättävä sukulaiskansa

    5. 5

      Arjen kuluttama yksinhuoltajaäiti Ronja, 41, purskahti itkuun katsottuaan peiliin tv-ohjelman muutoksen jälkeen – katso kuvat!

    6. 6

      Jari Sarasvuolle tehty operaatio epäonnistui: syöminen sietämätöntä ja puhe epäselvää – ”SM-bondage-häkkyrä laukesi suussani”

    7. 7

      Vartiointikuluissa hillitön piikki – veronmaksajat vaativat Melania Trumpia muuttamaan Valkoiseen taloon

    8. 8

      Yksi varomaton lause Dr. Phil -ohjelmassa teki Daniellesta, 14, megajulkkiksen – ”Hän on varmasti miljonääri vuoden lopussa”

    9. 9

      Osaatko ratkaista japanilaisinsinöörien ”helpon” matematiikkapähkinän? Alle 60 prosenttia vastasi oikein

    10. 10

      Jani Sievinen julkaisi itsestään herkuttelumeemin 20 kiloa lihavampana: ”6 vuotta sitten ei olisi paljon naurattanut...”

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Yksi varomaton lause Dr. Phil -ohjelmassa teki Daniellesta, 14, megajulkkiksen – ”Hän on varmasti miljonääri vuoden lopussa”

    2. 2

      Raisa Räisäsen mysteeristä ja Pasi Aaltosen murhasta paljastui erikoinen yhteys – keskiössä tamperelainen pubi

    3. 3

      HS: Kahvi uhkaa loppua maailmasta, tilanne dramaattisen vakava – myös Suomen Paulig on huolissaan

    4. 4

      Jari Sarasvuolle tehty operaatio epäonnistui: syöminen sietämätöntä ja puhe epäselvää – ”SM-bondage-häkkyrä laukesi suussani”

    5. 5

      Osaatko ratkaista japanilaisinsinöörien ”helpon” matematiikkapähkinän? Alle 60 prosenttia vastasi oikein

    6. 6

      Bikinipöksyt kokevat tänä kesänä muodonmuutoksen – pukisitko itse yllesi?

    7. 7

      Janni Hussilta rankka avautuminen saamastaan arvostelusta eron jälkeen: ”Olen kuullut, kuinka olen lihonut”

    8. 8

      Autotehtaan 30 000 euron vuosipalkka herätti ihmetystä – näin Valmet Automotive vastaa

    9. 9

      Teinitytöt legginseissä käännytettiin lähtöportilla, somemyrsky nousi USA:ssa – huippumalli Chrissy Teigen: ”Olen lentänyt ilman housuja”

    10. 10

      Jopa kolmannes syövistä voitaisiin välttää – 15 ruokaa, jotka ehkäisevät syöpää

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Merkel tyrmistyi ”hävyttömästä” tempusta – Trump ojensi 350 miljardin laskun

    2. 2

      Nuoren naisen asunnosta levisi karmea haju 48 asunnon taloyhtiöön – löydön puhdistamiseen tarvittiin siirtolava

    3. 3

      Bikinipöksyt kokevat tänä kesänä muodonmuutoksen – pukisitko itse yllesi?

    4. 4

      Teinityttö tervehti tuntematonta miestä koulumatkalla – siitä käynnistyi painajainen

    5. 5

      Tiesitkö? Helsingissä asuu yksi kaikkein aikojen menestyneimmän heviyhtyeen kitaristi – rakastui suomalaiseen Mariaan, elää nyt lapsiperheen arkea Suomessa

    6. 6

      IS seurasi tapahtumien etenemistä: Terrori-isku parlamentin luona Lontoossa – 4 kuoli

    7. 7

      Teinityttö julkaisi hervottoman kuvaparin äidistään kostean illanvieton jälkeen – kiusallinen kuva villitsee somessa: ”Lauantai ja sunnuntai”

    8. 8

      Vihreä Nissan lepää kyljellään Tornion keskustassa – poliisi kertoo, miksi ei puutu tapaukseen

    9. 9

      Albinismia sairastavat kaksostytöt ihastuttavat malleina – poseeraavat nyt yhdessä tumman isosiskonsa kanssa

    10. 10

      Pilvi Hämäläiselle kävi hillitön asumoka – saapui Jussi-gaalaan Aina Inkerin polvisukissa: ”En muistanut, että mulla on halkio”

    11. Näytä lisää
    Näitä luetaan!
    1. 1

      Siepattu ruotsalainen YK-työntekijä löydettiin kuolleena

    2. 2

      Teemu Selänne harmissaan parhaan tutkaparinsa puolesta: ”Surullista, että hän on erittäin katkera jääkiekolle”

    3. 3

      Tunnistaisitko? David Beckham julkaisi rujon kuvan naamastaan – fanit kauhistuivat näystä: ”Mitä sinulle on tapahtunut?”

    4. 4

      Alastomuutta saunassa vaativille suomalaisille löytyi yllättävä sukulaiskansa

    5. 5

      Arjen kuluttama yksinhuoltajaäiti Ronja, 41, purskahti itkuun katsottuaan peiliin tv-ohjelman muutoksen jälkeen – katso kuvat!

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Yksi varomaton lause Dr. Phil -ohjelmassa teki Daniellesta, 14, megajulkkiksen – ”Hän on varmasti miljonääri vuoden lopussa”

    2. 2

      Raisa Räisäsen mysteeristä ja Pasi Aaltosen murhasta paljastui erikoinen yhteys – keskiössä tamperelainen pubi

    3. 3

      HS: Kahvi uhkaa loppua maailmasta, tilanne dramaattisen vakava – myös Suomen Paulig on huolissaan

    4. 4

      Jari Sarasvuolle tehty operaatio epäonnistui: syöminen sietämätöntä ja puhe epäselvää – ”SM-bondage-häkkyrä laukesi suussani”

    5. 5

      Osaatko ratkaista japanilaisinsinöörien ”helpon” matematiikkapähkinän? Alle 60 prosenttia vastasi oikein

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Merkel tyrmistyi ”hävyttömästä” tempusta – Trump ojensi 350 miljardin laskun

    2. 2

      Nuoren naisen asunnosta levisi karmea haju 48 asunnon taloyhtiöön – löydön puhdistamiseen tarvittiin siirtolava

    3. 3

      Bikinipöksyt kokevat tänä kesänä muodonmuutoksen – pukisitko itse yllesi?

    4. 4

      Teinityttö tervehti tuntematonta miestä koulumatkalla – siitä käynnistyi painajainen

    5. 5

      Tiesitkö? Helsingissä asuu yksi kaikkein aikojen menestyneimmän heviyhtyeen kitaristi – rakastui suomalaiseen Mariaan, elää nyt lapsiperheen arkea Suomessa

    6. Näytä lisää