Digitoday

Valikko

Yhdysvaltain terveysinstituutti valitsi Crayn

Julkaistu:

Kun ihmiskunnan tärkeimmäksi nimetty tutkimus on siirtymässä vähitellen geenien kartoittamisesta proteiinien kartoittamiseen ja analysointiin, on tehtävässä käytettävä laskentatehon tarve lisääntymässä. Tämä johtuu siitä, että proteiinien analysointiin ei ole vielä kehitetty yhtä tehokkaita menetelmiä kuin geenien kartoittamiseen.
Laskentatehoa Yhdysvaltain terveysinstituutin alajaostolle tuo sen valinta uudesta supertietokoneesta. Organisaatio päätti hankkia Crayn XD1 –järjestelmän huolehtimaan proteiinien analysoinnista ja molekyylimallinnuksesta. Crayn edustajien mukaan XD1 nopeuttaa merkittävästi tieteellistä tutkimusta. Esimerkiksi proteiinin rakenteen mallinnus vie nykyisellään yhdeksän kuukautta. Sama tehtävä uudella koneella tehtynä ottaa kaksi viikkoa.

Uusi järjestelmä asennetaan lähiaikoina terveysinstituutin tutkimuslaboratorioon Pohjois-Caroliinaan. Instituutin edustaja on innoissaan uudesta kapasiteetista. Hänen mukaansa tunnettujen proteiinien aminohappoketjujen määrä ja toisaalta tunnettujen 3D-proteiinimallien määrä eivät kohtaa. Kyseessä on yksi nykyisen biologian suurista haasteista. Ongelman ratkaisu mahdollistaisi syvällisen tietämyksen esimerkiksi sairauksien geneettisestä pohjasta sekä mahdollistaisi tehokkaiden lääkkeiden kehityksen.

Cray XD1 on helposti skaalautuva superkonejärjestelmä. Yhdessä yksikössä on 12 prosessoria ja laskentatehoa on 58 gigaFLOPia. Tälläisiä laitteita saa asennettua yhteen standardiräkkiin 12 kappaletta ja räkkejä voi olla toisiinsa liitettynä useita.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!
    1. 1

      Kasa käpyjä, 5 € – Lauralla paloi pinna naurettaviin hintoihin: ”Köyhällä ei ole varaa kirppistellä”

    2. 2

      Kannabiskasvattaja luuli keksineensä nokkelan piilon Joensuussa – ”ratamestarin erikoinen”

    3. 3

      F1-tähti Max Verstappenin huumoria koetellaan – Mika Salo: ”Aikamoinen isku vyön alle”

    4. 4

      Pariskunta harrasti seksiä muina miehinä käytävällä – mies lausui kommentin, joka jäi hotellin työntekijän mieleen

    5. 5

      Susanna Tanni poseeraa pienissä bikineissä: ”Uskoisitko, että olen viiden lapsen äiti?”

    6. 6

      Suomalaistenkin suosimalta lomasaarelta paljastui epäilty terroristisolu

    7. 7

      Oletko mennyt liian pitkälle? 9 merkkiä, jotka kertovat henkisestä pettämisestä

    8. 8

      ”Kyberpommit” odottavat laukaisua – WP: näin Yhdysvallat vastasi Venäjän hakkerointiin

    9. 9

      Linda Lampenius avautuu suuresta surustaan Eeva-lehdelle: ”Tuntui kuin sydän olisi revitty rinnastani irti”

    10. 10

      4 merkkiä siitä, että lapsesi on keskivertoa älykkäämpi

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Pariskunta harrasti seksiä muina miehinä käytävällä – mies lausui kommentin, joka jäi hotellin työntekijän mieleen

    2. 2

      Eevi Teittisen bikinikuva nostatti raivon – seuraajat ärähtivät tähden tökerölle lausunnolle: ”Niin kaukana totuudesta kuin voi olla”

    3. 3

      ”Pelkäsin että lapseni ihonväri olisi eri kuin miehelläni” – Vauva.fi:ssä paljastetaan nyt salaisuudet, joita kukaan ei tiedä

    4. 4

      Posti perustelee jakelumuutosta – ”Suo siellä, vetelä täällä”

    5. 5

      17-vuotias tyttö kuoli benji-turmassa kielimuurin vuoksi

    6. 6

      Lähtisitkö tässä mekossa juhlimaan? Susanna Penttilän todella rohkea asuvalinta hämmentää: ”Eikö tuohon kuulu pikkupöksyjä lainkaan?”

    7. 7

      Pikkulapsi putosi neljästä metristä suoraan kivilattialle Tampereella – kaiteessa vakavia puutteita

    8. 8

      Vuokralainen käytti vessaa suihkuna – hiukset tukkivat lattiakaivon karmein seurauksin

    9. 9

      Kyösti Pietiläinen on kuollut – palveli muukalaislegioonassa yli 28 vuotta

    10. 10

      ”Legioonalainen Peters” on poissa: Kyösti Pietiläisen uskomaton elämä – merimiehestä palkkasoturiksi

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Naisen alastoman ruumiin vierestä löytyi kastikekauha, jonka hirvittävä tarkoitus selvisi pian poliisille – missä ovat heidän murhaajansa?

    2. 2

      Kesäyö innosti pariskunnan niin villiin seksiin, ettei tuhoilta vältytty – leirintäalueen johtaja kertoo näkymästä, joka ei unohdu

    3. 3

      Yksi tehtävä juhannusaatolta herätti kysymyksiä Hämeen poliisissa: ”Mitä ihmettä ihmisten mielessä liikkuu”

    4. 4

      Eevi Teittisen bikinikuva nostatti raivon – seuraajat ärähtivät tähden tökerölle lausunnolle: ”Niin kaukana totuudesta kuin voi olla”

    5. 5

      Suomalaisseurueen kotimatka Kroatiasta tyssäsi, kun kännykkään kilahti viesti – ”Loput 120 seisoivat kentällä tumput suorina ja ihmettelivät”

    6. 6

      Pirullisen vaikea tarkkuustesti testaa hoksottimesi

    7. 7

      Kris Jennerin paljastavasta salikuvasta löytyi nolo moka: kuvanmuokkaus meni pahasti pieleen – jopa fanit kritisoivat: ”Surullista!”

    8. 8

      Kotihälytyskeikalla odotti näky, joka riipaisi jopa vanhan sosiaalityöntekijän sydäntä – viranomaiset vetoavat juhannusjuhlijoihin

    9. 9

      Livelähetys Prisman kassahihnasta nousi megahitiksi – erityisesti eräs ostohetki synnytti villejäkin teorioita

    10. 10

      Onko sinullakin viinanaama? Vertaa tätä kuvaa peilikuvaasi

    11. Näytä lisää
    Näitä luetaan!
    1. 1

      Kasa käpyjä, 5 € – Lauralla paloi pinna naurettaviin hintoihin: ”Köyhällä ei ole varaa kirppistellä”

    2. 2

      Kannabiskasvattaja luuli keksineensä nokkelan piilon Joensuussa – ”ratamestarin erikoinen”

    3. 3

      F1-tähti Max Verstappenin huumoria koetellaan – Mika Salo: ”Aikamoinen isku vyön alle”

    4. 4

      Pariskunta harrasti seksiä muina miehinä käytävällä – mies lausui kommentin, joka jäi hotellin työntekijän mieleen

    5. 5

      Susanna Tanni poseeraa pienissä bikineissä: ”Uskoisitko, että olen viiden lapsen äiti?”

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Pariskunta harrasti seksiä muina miehinä käytävällä – mies lausui kommentin, joka jäi hotellin työntekijän mieleen

    2. 2

      Eevi Teittisen bikinikuva nostatti raivon – seuraajat ärähtivät tähden tökerölle lausunnolle: ”Niin kaukana totuudesta kuin voi olla”

    3. 3

      ”Pelkäsin että lapseni ihonväri olisi eri kuin miehelläni” – Vauva.fi:ssä paljastetaan nyt salaisuudet, joita kukaan ei tiedä

    4. 4

      Posti perustelee jakelumuutosta – ”Suo siellä, vetelä täällä”

    5. 5

      17-vuotias tyttö kuoli benji-turmassa kielimuurin vuoksi

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Naisen alastoman ruumiin vierestä löytyi kastikekauha, jonka hirvittävä tarkoitus selvisi pian poliisille – missä ovat heidän murhaajansa?

    2. 2

      Kesäyö innosti pariskunnan niin villiin seksiin, ettei tuhoilta vältytty – leirintäalueen johtaja kertoo näkymästä, joka ei unohdu

    3. 3

      Yksi tehtävä juhannusaatolta herätti kysymyksiä Hämeen poliisissa: ”Mitä ihmettä ihmisten mielessä liikkuu”

    4. 4

      Eevi Teittisen bikinikuva nostatti raivon – seuraajat ärähtivät tähden tökerölle lausunnolle: ”Niin kaukana totuudesta kuin voi olla”

    5. 5

      Suomalaisseurueen kotimatka Kroatiasta tyssäsi, kun kännykkään kilahti viesti – ”Loput 120 seisoivat kentällä tumput suorina ja ihmettelivät”

    6. Näytä lisää